Neben der Gesamtleitung des Vereins Katholische Jungschar Österreichs gehören unter anderem Behelfeproduktionen, inhaltliche Auseinandersetzungen mit kinderrelevanten Themen, gesellschaftspolitisches Engagement, österreichweite Vernetzung, (Weiterbildungs-)Veranstaltungen und Kontakt zu anderen Kinderorganisationen zu den Agenden auf Bundesebene.
Dazu tagt auch zweimal jährlich der Bundesführungskreis (BFK) und bestimmt die grundlegende Ausrichtung der Katholischen Jungschar Österreichs. Der Bundesführungskreis setzt sich zusammen aus den Diözesanleitungen der 9 österreichischen Diözesen und der Diözesanleitung der Diözese Bozen-Brixen (Südtirol). Er wählt auf zwei Jahre die Bundesleitung, bestehend aus 3 ehrenamtlichen Vorsitzenden, sowie weiteren 8 gewählten Mitgliedern aus den Diözesen.
